
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
分析数据
钻研的人员来探寻发生变化冷冻箱时间隔延缓牛羊肉的洛氏对抗强度、持水力发电、有光泽度度、悬浮铁含水量、ROS、脂质过氧化物质物、MDA、GSH和GPX4技术来风险评估腹肌策划 生殖上皮细胞的铁牺牲壮态。后果展现,冷冻箱时间隔延缓后,牛羊肉的洛氏对抗强度在第四天和第6天正相关减少;持水的能力下降;色泽变深,抛弃有光泽度,鲜橙黄色换成暗橙黄色。另外,悬浮铁、抗逆性氧和MDA的含水量正相关不断增加,生殖上皮细胞凋亡率正相关变高。 探析职工提现不相同的冷库准确时间的肌肤供试品管理的球膳食纤维,以后做好SDS-PAGE讲解,球膳食纤维条带在不相同的南北朝时期分布不均均衡且类似于(图1a)。基于球血清在不相同的供试品管理中的呈现状态,讲解感觉同种组供试品管理的中六位数快要于同种总体水平(图1b),解释肌肤供试品管理球膳食纤维享有好的的组内类似于性和组间之间的关系性。 蛋清质组学共评定出1996种蛋清质。以B0为比组,筛分B1、B2、B4和B6中的蛋清实施差别的表答的方式数据定量分析,共评定到37七个DEPs。将火山图交互式,并要根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05俩标准规范数据定量分析DEP。結果如图是1c-f一样,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别评定出22、33、73和140个DEPs,进来分刘海别调整6、11、32和8七个,降低16、22、41和5俩。聚类分析的方式估评了与众不同冰箱时候健身全身肌肉组织安排中蛋清质的表答的方式,結果显示信息健身全身肌肉蛋清表答的方式差别的近年来永久保存耗时的加大而加大(图1g)。
图1| 多种冰箱事件的胸肌样品管理胆固醇质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所差异化保温用时的腿部肌肉检样差异化球蛋白数据分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁突然死亡蛋清肽的PRM按量具体分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 源于KEGG生物富集距离表达爱球蛋白的铁死掉体制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物制品提供了TMT降钙素原检测核营养物质组学新技术水平咨询培训,拜谱微生物已研制实现并确立了不断完善成熟稳重的转录组学、核蛋白酶组学、分解代谢组学或多个学协力设备新技术水平咨询培训装修标准,欢迎致电咨询!
参考价值论文参考文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.