
2024年9月由武汉林果院校张万刚讲师微商团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物学为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名关键词:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2025年不良影响成分:5.7
收录时光:2024年9月
用户政府部门:南京农业大学
研究方案用料:蛋白
拜谱提供数据系统:亚硝基化修饰组学
高技术自驾路线:
一、研究方案结杲
01.Caspase-3催化活性
目前为止尚不模糊不清NO对caspase-3的控制造用需不需要归因于NO介导的S-亚硝基化,各种氧浓度均值的GSNO当做外源性NO供应商,以诱惑caspase-3的离体S-亚硝基化。最终结果显示,与沒有GSNO的组相较,100、200和400μM GSNO组的caspase-3亲水性偏态减少(图1),与仍然媒体报道完全一致。GSNO进行处理减少caspase-3亲水性的潜在性因为仍欠缺阐释。
图1 不一样的溶液浓度的GSNO治疗对caspase-3生物的关系
02.Caspase-3的S-亚硝基化限度
探究Caspase-3的亚硝基化度,以阐释GSNO对Caspase-3的的反应性。经GSNO治理后,检查到caspase-3球蛋白S-亚硝基化力度增长(图2)。一些最后得出结论,外源性GSNO培養可成功的英文诱导性caspase-3的休外S-亚硝基化。引人难以相信的是,在不会GSNO有的相较比较组中检查到一些衰弱的S-亚硝基化带,这得出结论caspase-3或许遭受内源性的S-亚硝基化。与此同时,本探究中caspase-3的S-亚硝基化度较高,而caspase-3的催化活性减低,这与先前的探究不一样。所以,caspase-3的特喜欢的人S-亚硝基化体现位点尚不清,还是需要进十步的探究。
图2 GSNO加工对caspase-3S-亚硝基化技术水平的影向
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化绘制组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的编码回文序列。蓝颜色记号的编码回文序列表明S-亚硝基化肽,黑色记号的C表明S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3生物降解结核蛋白
结核核血清是 本身注重的人体细胞核骨架核核血清,在保护肌人体细胞核空间形式的空间形式齐全性和抽缩性层面起着注重功效,探讨S-亚硝基化caspase-3对结核核血清分解的敏感脆弱性具备注重积极意义。与Std(未用胱天核核血清酶-3和GSNO孵育的刚开始肌合成纤维材料核核血清)组相对比,0 μM GSNO组(肌原合成纤维材料和caspase-3的孵育,无GSNO)的齐全结核核血清分量取得减小,报错caspase-3对结核核血清具备不确定性的核核血清电离技能。在GSNO孵育后,齐全结核核血清的分量特别不断增加(P < 0.05)。另外,当GSNO密度身高时,齐全结核核血清的分量持继上浮(P < 0.05)(图5)。这样遇到体现了,SNO掩盖的caspase-3以标准依赖关系的行为缓和结核核血清的分解。
图5.S-亚硝基化caspase-3分解结淀粉酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3降解塑料肌钙球蛋白-T
肌钙球淀粉酶-T (TnT)是原肌球球淀粉酶设定承担责任肌肤做收缩的细条的需要肌原人造食物氯纶球淀粉酶。TnT的挥发表现形式是加测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化具体条件下,caspase-3对TnT的挥发条件下图6已知,与Std组(不含有caspase-3和GSNO的肌原人造食物氯纶)比较,caspase-3组中30 kDa TnT细节描写强势新增,得出结论caspase-3直接参与了TnT的挥发,因此,caspase-3与GSNO的孵育导至30 kDa TnT有效调低。在100和200 μM GSNO组期间无加测到很深的差距(P > 0.05),而当GSNO的溶液浓度符合400 μM 时,该细节描写强势减小(P < 0.05)。某些显示得出结论了SNO掩盖的caspase-3对TnT挥发的仰生产用。结球淀粉酶和TnT是caspase-3的敏锐底物,而GSNO补救有效调低caspase-3的催化活性酶会导至肌原人造食物氯纶球淀粉酶挥发阶段有效调低。上面指出,NO诱导型的S-亚硝基化就可以在掩盖半胱氨酸残基来设定caspase-3的催化活性酶,借以进两步直接引响其对结球淀粉酶和TnT的球淀粉酶淀粉水解工作能力,可以直接引响鸡肉品质保证。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙蛋白质-T
二、个人心得体会
本探索指在刍议S-亚硝基化对caspase-3呈现的损害到以及随即对牛羊肉肌原食物纤维棉离体化学降解的损害到。蛋白质质酶S-亚硝基化行呈现caspase-3的半胱氨酸残基,最终得以促使caspase-3生物调低,进几步调控了其对牛羊肉肌原食物纤维棉蛋白质质酶的蛋白质质酶蛋白质水解工作能力。三、拜谱总结
探究选取了酶活旋光度的测定,亚硝基化突显语组学理论研究分析,WB等查重措施,找到蛋白酶质质酶S-亚硝基化是可以突显语caspase-3的半胱氨酸残基,这导至了caspase-3可溶性的拉低,并举一步骤限制了其对牛羊肉肌原纤维棉蛋白酶质质酶的蛋白酶质质酶蛋白酶质水解意识。本探究为讲解蛋白酶质质酶质亚硝基化对色泽的政策调控措施展示半个个新的感觉。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的淀粉酶质组学、突显淀粉酶质组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸型号物料,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺硝化作用、total防氧化抹除、解离巯基,欢迎大家咨询!
参考选取学术论文:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663