
近日,苏州医科大时首先附设青岛博士整形医院医院王学浩教授的团队在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白质互作组和靶向治疗电能分解代谢检测分析服务。
因为子标题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
简体中文关键词:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
业主工作单位:南京医科大学
科研的原材料:细胞
拜谱带来服务培训:转录组测序+球蛋白互作组+靶向药物能量转换新陈代谢组
技能行车路线:
学习数据
01、YBX1被鉴定费为HCC中糖酵解的的关键染色体
本探索采集工具HCC癌肿范例(n=7)的单神经人体组织细胞RNA测序数值集实现研究具体定性分析,发展糖酵解抗逆性常见集结在癌肿神经人体组织细胞中,hdWGCNA研究具体定性分析判断出9个基因组组件(图1A-G)。TCGA-LIHC列队的存活研究具体定性分析认定YBX1为独立性存活风险隐患方面(图1H)。进一部融入IHC、WB實驗和癌肿组织性结构与靠近非癌肿组织性结构的空间区域转录组学数值集核实YBX1是肝神经人体组织细胞癌制疗的内在的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被明确为转换HCC神经元糖酵解的重要条件
02、YBX1促使HCC中的有氧糖酵解和增值
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向治疗电能产生组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1力促HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1整合并驱动YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋白质互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1结合实际并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化增強其磷碱化,然而有助于其核转位
进一大步查重YBX1的O-GlcNAc糖基化是不是也引响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC受损生殖细胞中或用OGT抑制性剂OSMI-1治疗,YBX1血清质水准正相关影响,YBX1磷酸性反应正相关缩减(图4A-C)。IP实验设计展现,在不同的Flag-YBX1底物水准下,YBX1-WT的磷酸性反应水准正相关超出YBX1-T57A,表述磷酸性反应的上升并不是仅是担心越来越高的YBX1血清质表明(图4D)。转移了核和质类物质得知TMG治疗的HCC受损生殖细胞中YBX1核表明的增大(图4E-F),进一大步得知YBX1磷酸性反应的要素调试成分是AKT(图4G-I)。这得知反复强调O-GlcNAc糖基化确认利于其磷酸性反应来增进YBX1血清质稳定的性并利于核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 体现有助于于其进一歩发现磷碱化体现并都可以使得其核转位
05、YBX1提高PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1促进会PKM2转录
06、YBX1 就可以升高组淀粉酶乳碱化绘制总体水平
深入分析得知YBX1敲低偏态减小了蛋清酶质乳硝凝成用,特别是在是H3K18乳硝凝成用(图6A-C)。糖酵解阻止剂2-DG的實驗断定了糖酵解与组蛋清酶乳硝凝成用的随时性相互影响,阻止糖酵解可偏态减小了H3K18la标准(图6D)。PKM2过呈现可逆性转YBX1敲低导致的的H3K18la减少,以外源乳酸加工处理仅仅提高了H3K18la,还伴随着YBX1呈现上浮,表示的存在双向评价(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR断定,H3K18la能够 含有于YBX1重新启动子随时性有利于其转录,该的时候受O-GlcNAc糖基化宏观调控(图6H-J),并得知P300 上浮是YBX1加强H3K18乳酰凝成用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1资料H3K18乳碱化修饰语水平方向
软文工作小结
在某项的研究中新闻报导了YBX1在HCC中高描述,关键在于与糖酵解谜切一些。YBX1在T57处被O-GlcNAc呈现,关键在于稳固氨基酸质并提升其描述。此类呈现还有利于YBX1在T57处的磷碱化,有利于其核易位。以至于,这一项步骤提高了糖酵解一些DNA的转录并刺激性乳酸的导致。然而,YBX1促活P300的转录,以求驱动程序组氨基酸的乳碱化,特别的是H3K18la,H3K18乳碱化正面房产调控YBX1DNA转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正负极馈环原则图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,核蛋白互作组和靶向药物力量消化吸收组技术服务,拜谱菌物建立了完善成熟的转录组学、蛋白酶组学、全文翻译后修饰语组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
规范学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.